Università Roma Tre

INTRODUZIONEBIOINFORMATICA E BIOINFORMATICA STRUTTURALE; STRUTTURA DELLE PROTEINE, DEL DNA E DELLO RNA.

TECNICHE DI INDAGINE A SCALA ATOMICA (CRISTALLOGRAFIA, NMR, SPETTROSCOPIA LASER, CRIO-MICROSCOPIA ELETTRONICA (CRYO-EM)); TECNICHE E STRUMENTI DI MODELLAZIONE E VISUALIZZAZIONE MOLECOLARE COMPUTERIZZATA

RAPPRESENTAZIONI E DATABASEFORMATO PDB; DATABASE DEGLI ACIDI NUCLEICI; ALTRI DATABASE; CONFRONTI STRUTTURALI E ALLINEAMENTI; VALIDAZIONI STRUTTURALI; DATABASE STRUTTURALI; STRUMENTI WEB PER PROTEOMICA E GENOMICA

STRUTTURA E FUNZIONELA SINTESI DELLE PROTEINE E DEI PRINCIPALI COMPONENTI DELL’UOMO. LA CELLULA NORMALE E QUELLE SPECIALIZZATE (ORGANI DI SENSO, NEURONI, CELLULE IMMUNITARIE, ECC.). RECETTORI E NEUROTRASMETTITORI CEREBRALI.

STRUTTURA SECONDARIA E TERZIARIA; IDENTIFICAZIONE DEI DOMINI STRUTTURALI NELLE PROTEINE; INFERENZA DELLE FUNZIONI DALLA STRUTTURA DELLE PROTEINE. INTERAZIONI PROTEICHE, PREDIZIONE DELLE FUNZIONI DA INFORMAZIONI EVOLUZIONARIE; INTERAZIONI ELETTROSTATICHE

PREDIZIONI STRUTTURALI E PROGETTO DI FARMACIMODELLAZIONE OMOLOGICA; RICONOSCIMENTO DEI FOLDING; METODI AB-INIZIO. DOCKING E PROGETTO DEI LIGANDI; STRUTTURA DELLE PROTEINE E PROGETTO DI FARMACI; CADD: COMPUTER-AIDED DRUG DESIGN

TRASPARENZE DELLE LEZIONI

ARTHUR M. LESK, "INTRODUCTION TO BIOINFORMATICS", OXFORD UNIVERSITY PRESS, 3RD ED., 2008.

PHILIP E. BOURNE, HELGE WEISSIG, "STRUCTURAL BIOINFORMATICS", JOHN WILEY & SONS, 2ND. ED., 2009.

6 CREDITI: 40 ORE DI LEZIONI, 20 ORE DI ESERCITAZIONI.

ESAME: (1) PROGETTO; (3) DISCUSSIONE ORALE DEL PROGETTO.