Università Roma Tre

1. Evoluzione e sistematica dei microrganismi
Origine dei batteri; filogenesi molecolare; gene per il 16S rRNA ed evoluzione; fondamenti di sistematica dei microrganismi
2. Diversità metabolica nei microrganismi
Chemiolitotrofia; fermentazioni; respirazione anaerobia; fototrofia
3. Diversità funzionale dei microrganismi
Batteri fototrofi e chemiotrofi; batteri nei cicli di azoto e zolfo
4. I principali gruppi filogenetici di Bacteria
Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Ipertermofili
5. I principali gruppi filogenetici di Archea
Phyla ed evoluzione; Euryarchaeota, altri; estremofili
6. Metodi di studio in ecologia microbica
Metodi colturali; analisi attività funzionali.
Metodi indipendenti dalla coltivazione: microscopia, analisi genetiche e genoma; metagenomica
7. Gli ecosistemi microbici
Principi di ecologia
Ambiente microbico: Interazioni microbiche (Quorum sensing; Biofilm)
Ambiente terrestre: il suolo
Ambienti acquatici: acque dolci; mare
Ambienti estremi (abissi; sorgenti idrotermali)
8. Ruolo microbico nei cicli dei nutrienti
Carbonio, azoto, zolfo; altri
9. Simbiosi tra microrganismi e tra microrganismi e organismi diversi
Piante; rizosfera; noduli radicali
Mammiferi; microbioma intestinale; rumine
10. I microrganismi negli ambienti antropizzati
Biorisanamento di siti contaminati; trattamento acque; biocorrosione; recupero di minerali da miniere.

Libro di testo: Brock. Biologia dei microrganismi. Microbiologia generale, ambientale e industriale.
Madigan et al., Pearson Editore (XIV ed.)