Metodi per lo studio del funzionamento di proteine ed enzimi
(obiettivi)
Imparare ad acquisire, analizzare ed esaminare criticamente i dati sperimentali relativamente a:interazione tra recettori e ligandi, attività enzimatica, spettroscopia ottica
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Codice
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20410600 |
Lingua
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ITA |
Tipo di attestato
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Attestato di profitto |
Modulo: Primo modulo
(obiettivi)
Imparare ad acquisire, analizzare ed esaminare criticamente i dati sperimentali relativamente a:interazione tra recettori e ligandi, attività enzimatica, spettroscopia ottica
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Lingua
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ITA |
Tipo di attestato
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Attestato di profitto |
Crediti
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4
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Settore scientifico disciplinare
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BIO/11
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Ore Aula
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32
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Attività formativa
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Attività formative affini ed integrative
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Canale Unico
Docente
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ANTONINI GIOVANNI
(programma)
Imparare ad acquisire, analizzare ed esaminare criticamente i dati sperimentali relativamente a:interazione tra recettori e ligandi, attività enzimatica, spettroscopia ottica. Il programma si articola in: 1) Studio della interazione tra recettori e ligandi: metodi all’equilibrio e cinetica dei transienti a) All’equilibrio (parametri termodinamici: Kd costante di equilibrio in dissociazione, cooperatività, numero di siti di legame) b) Cinetica rapida (parametri cinetici: k costanti di velocità) 2) Studio della attività enzimatica: cinetica in stato stazionario a) In Stato Stazionario (quando [ES] è pressochè costante durante l’osservazione sperimentale) b) In presenza di inibitori 3) Spettroscopia ottica risolta nel tempo e cinetiche complesse 4) Spettroscopia di assorbimento, fluorescenza e dicroismo circolare
(testi)
Libri di testo consigliati: M. C. Bonaccorsi di Patti et al. Metodologie Biochimiche - Casa Editrice Ambrosiana Ninfa/Ballou Metodologie di base per la Biochimica e la Biotecnologia - ed. Zanichelli Reed et al. Metodologie di Base per le Scienze Biomolecolari- ed. Zanichelli P. Silvestroni, Fondamenti di chimica - Casa Editrice Ambrosiana D.M. Etter Introduction to MATLAB 7– Pearson Education, Inc.
Software da utilizzare EXCEL (Office) oppure CALC (Open Office)* (per metodi lineari) MATLAB (Mathworks) o OCTAVE (GNU Octave)* (per analisi spettri e metodi non lineari) GEPASI (P. Mendes et al.)* oppure COPASI (Copasi dev. group)* (per reazioni complesse) (*) indica free software
Saranno fornite dispense delle lezioni ed esercizi svolti
Il professore riceve tutti i giorni dalle 8.00 alle 9.00 previo appuntamento via mail: giovanni.antonini@uniroma3.it
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Date di inizio e termine delle attività didattiche
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Dal al |
Modalità di erogazione
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Tradizionale
A distanza
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Modalità di frequenza
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Obbligatoria
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Metodi di valutazione
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Prova orale
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Modulo: Secondo modulo
(obiettivi)
Imparare ad acquisire, analizzare ed esaminare criticamente i dati sperimentali relativamente a:interazione tra recettori e ligandi, attività enzimatica, spettroscopia ottica
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Lingua
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ITA |
Tipo di attestato
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Attestato di profitto |
Crediti
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2
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Settore scientifico disciplinare
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BIO/11
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Ore Aula
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16
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Attività formativa
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Attività formative affini ed integrative
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Canale Unico
Docente
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GALLO VALENTINA
(programma)
Imparare ad acquisire, analizzare ed esaminare criticamente i dati sperimentali relativamente a:interazione tra recettori e ligandi, attività enzimatica, spettroscopia ottica.
Il programma si articola in:
1) Studio della interazione tra recettori e ligandi: metodi all’equilibrio e cinetica dei transienti
a) All’equilibrio (parametri termodinamici: Kd costante di equilibrio in dissociazione, cooperatività, numero di siti di legame)
b) Cinetica rapida (parametri cinetici: k costanti di velocità)
2) Studio della attività enzimatica: cinetica in stato stazionario
a) In Stato Stazionario (quando [ES] è pressochè costante durante l’osservazione sperimentale)
b) In presenza di inibitori
3) Spettroscopia ottica risolta nel tempo e cinetiche complesse
4) Spettroscopia di assorbimento, fluorescenza e dicroismo circolare
(testi)
Libri di testo consigliati:
M. C. Bonaccorsi di Patti et al. Metodologie Biochimiche - Casa Editrice Ambrosiana
Ninfa/Ballou Metodologie di base per la Biochimica e la Biotecnologia - ed. Zanichelli
Reed et al. Metodologie di Base per le Scienze Biomolecolari- ed. Zanichelli
P. Silvestroni, Fondamenti di chimica - Casa Editrice Ambrosiana
D.M. Etter Introduction to MATLAB 7– Pearson Education, Inc.
Software da utilizzare
EXCEL (Office) oppure CALC (Open Office)* (per metodi lineari)
MATLAB (Mathworks) o OCTAVE (GNU Octave)* (per analisi spettri e metodi non lineari)
GEPASI (P. Mendes et al.)* oppure COPASI (Copasi dev. group)* (per reazioni complesse)
(*) indica free software
Saranno fornite dispense delle lezioni ed esercizi svolti
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Date di inizio e termine delle attività didattiche
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Dal al |
Modalità di frequenza
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Non obbligatoria
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Metodi di valutazione
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Prova orale
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