Università Roma Tre

ELEMENTI DI TERMODINAMICA: ENERGIA LIBERA, ENTALPIA, ENTROPIA. PROPRIETÀ DELL'ACQUA. PROPRIETÀ DEGLI AMMINOACIDI: STRUTTURA, IDROFOBICITÀ, INTERAZIONI. STRUTTURA DELLE PROTEINE: STRUTTURA PRIMARIA, STRUTTURE SECONDARIE, STRUTTURE SUPERSECONDARIE (MOTIVI STRUTTURALI BETA-ALFA-BETA, CILINDRO BETA, JELLY ROLL, T-KNOT, WW DOMAIN). STABILITÀ DELLE PROTEINE: INTERAZIONI COVALENTI, INTERAZIONI NON COVALENTI. RAPPORTI STRUTTURA-FUNZIONE: TRASPORTO IONICO (RODOPSINE, CANALE DEL POTASSIO, ACQUAPORINE), REAZIONI REDOX (SUPEROSSIDO DISMUTASI, AMMINO OSSIDASI, FOTOSISTEMI). RICONOSCIMENTO MOLECOLARE: PRICIPI TEORICI (INTERAZIONI ELETTROSTATICHE, INTERAZIONI IDROFOBICHE, FATTORI ENTROPICI), TOSSINE PROTEICHE, PROTEASI, PROTEINE CHE LEGANO IL DNA. INGEGNERIA PROTEICA: STRATEGIE E METODOLOGIE, INGEGNERIA STRUTTURALE E FUNZIONALE. DETERMINAZIONE DELLA STRUTTURA PROTEICA: NMR, DIFFRAZIONE DI RAGGI X. BIOINFORMATICA E CHIMICA COMPUTAZIONALE: BANCHE DATI, ANALISI DI SEQUENZE PROTEICHE, MODELLISTICA MOLECOLARE, DINAMICA MOLECOLARE, ELETTROSTATICA.

BRANDEN C. & TOOZE J. INTRODUZIONE ALLA STRUTTURA DELLE PROTEINE. ZANICHELLI, SECONDA EDIZIONE. PETSKO G.A. & RINGE D. STRUTTURA E FUNZIONE DELLE PROTEINE. ZANICHELLI. WILLIAMSON M. COME FUNZIONANO LE PROTEINE. ZANICHELLI. TRAMONTANO A. BIOINFORMATICA ZANICHELLI. VERRANNO INOLTRE FORNITI ARTICOLI SCIENTIFICI IN LINGUA INGLESE PER L'APPROFONDIMENTO DEI TEMI TRATTATI A LEZIONE.

ELEMENTI DI TERMODINAMICA: ENERGIA LIBERA, ENTALPIA, ENTROPIA. PROPRIETÀ DELL'ACQUA. PROPRIETÀ DEGLI AMMINOACIDI: STRUTTURA, IDROFOBICITÀ, INTERAZIONI. STRUTTURA DELLE PROTEINE: STRUTTURA PRIMARIA, STRUTTURE SECONDARIE, STRUTTURE SUPERSECONDARIE (MOTIVI STRUTTURALI BETA-ALFA-BETA, CILINDRO BETA, JELLY ROLL, T-KNOT, WW DOMAIN). STABILITÀ DELLE PROTEINE: INTERAZIONI COVALENTI, INTERAZIONI NON COVALENTI. RAPPORTI STRUTTURA-FUNZIONE: TRASPORTO IONICO (RODOPSINE, CANALE DEL POTASSIO, ACQUAPORINE), REAZIONI REDOX (SUPEROSSIDO DISMUTASI, AMMINO OSSIDASI, FOTOSISTEMI). RICONOSCIMENTO MOLECOLARE: PRICIPI TEORICI (INTERAZIONI ELETTROSTATICHE, INTERAZIONI IDROFOBICHE, FATTORI ENTROPICI), TOSSINE PROTEICHE, PROTEASI, PROTEINE CHE LEGANO IL DNA. INGEGNERIA PROTEICA: STRATEGIE E METODOLOGIE, INGEGNERIA STRUTTURALE E FUNZIONALE. DETERMINAZIONE DELLA STRUTTURA PROTEICA: NMR, DIFFRAZIONE DI RAGGI X. BIOINFORMATICA E CHIMICA COMPUTAZIONALE: BANCHE DATI, ANALISI DI SEQUENZE PROTEICHE, MODELLISTICA MOLECOLARE, DINAMICA MOLECOLARE, ELETTROSTATICA.

BRANDEN C. & TOOZE J. INTRODUZIONE ALLA STRUTTURA DELLE PROTEINE. ZANICHELLI, SECONDA EDIZIONE. PETSKO G.A. & RINGE D. STRUTTURA E FUNZIONE DELLE PROTEINE. ZANICHELLI. WILLIAMSON M. COME FUNZIONANO LE PROTEINE. ZANICHELLI. TRAMONTANO A. BIOINFORMATICA ZANICHELLI.

IL PROGRAMMA CONSISTE NELLO STUDIO DEI RAPPORTI STRUTTURA-FUNZIONE DI PROTEINE MODELLO: MIOGLOBINA, EMOGLOBINA, TRIPSINA, CHIMOTRIPSINA, ALBUMINA, CITOSCROMI E CITOCROMO OSSIDASI.

ORARIO DI RICEVIMENTO: LUNEDI' DALLE ORE 10 ALLE ORE 11

MCKEE, BIOCHIMICA, MCGRAW - HILL
NELSON, COX, I PRINCIPI DI BIOCHIMICA DI LEHININGER, ZANICHELLI
VOET, VOET, PRATT, FONDAMENTI DI BIOCHIMICA, ZANICHELLI
STRYER, BIOCHIMICA, ZANICHELLI
RAWN, BIOCHIMICA MCGRAW-HILL
MORAN ET AL., BIOCHIMICA MCGRAW-HILL
GARRET, GRISHAM, BIOCHIMICA, ZANICHELLI