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Docente
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PITZALIS MONICA
(programma)
CENNI SULLE SCUOLE DI SISTEMATICA: SCUOLA FENETICA, SCUOLA CLADISTICA E SCUOLA EVOLUZIONISTICA CLASSICA. LAPPROCCIO MORFOLOGICO NELLA SISTEMATICA: SELEZIONE DEI CARATTERI, STATO DEL CARATTERE E REALIZZAZIONE DI UNA MATRICE. APPROCCIO MOLECOLARE: SELEZIONE DEL MARCATORE MOLECOLARE E REALIZZAZIONE DI UNA MATRICE DI SEQUENZE NUCLEOTIDICHE ALLINEATE. METODI FENETICI: UPGMA. PRINCIPI E METODI DI ANALISI FILOGENETICA. ANALISI MULTIVARIATA APPLICATA ALLA FILOGENESI E ALLA SISTEMATICA. MATRICI DI DISTANZA E NEIGHBOR-JOINING (NJ). CRITERIO DELLA MASSIMA PARSIMONIA: METODI ESAUSTIVI, SEMIESAUSTIVI ED EURISTICI; VALUTAZIONE DEGLI ALBERI OTTENUTI E TECNICHE DI RESAMPLING: BOOTSTRAP E JACKKNIFE. MODELLI DI EVOLUZIONE MOLECOLARE (CENNI). MAXIMUM LIKELIHOOD. ANALISI BAYESIANA. ANALISI COMBINATE DI DATI MORFOLOGICI E MOLECOLARI. OROLOGI MOLECOLARI. SEMINARI: RAPPORTI FILOGENETICI NELLE ANGIOSPERME E NEI METAZOI IN RELAZIONE AI DATI MOLECOLARI. CASI DI STUDIO: APPLICAZIONI IN BIOGEOGRAFIA E IN GENETICA DI POPOLAZIONE. LEZIONI PRATICHE DI ANALISI DEI DATI IN SISTEMATICA MORFOLOGICA E MOLECOLARE. SOFTWARE UTILIZZATI NELLE ESERCITAZIONI: BIOEDIT, CLUSTAL, MEGA, PAUP, MODEL TEST, MR BAYES, TREEFINDER.
(testi)
FILE PDF DELLE LEZIONI SVOLTE E CONSULTAZIONE DEI SEGUENTI LIBRI:
E.O. WILEY, D. SIEGEL-CAUSEY, D.R. BROOKS, V.A. FUNK. THE COMPLEAT CLADIST, A PRIMER OF PHYLOGENETIC PROCEDURES. THE UNIVERSITY OF KANSAS PRINTING SERVICE.
M. NEI E S. KUMAR. MOLECULAR EVOLUTION AND PHYLOGENETICS. OXFORD UNIVERSITY PRESS, 2000.
P.L. FOREY, C.J. HUMPHRIES, I.L. KITCHING, R.W. SCOTLAND, D.J. SIEBERT AND D. M. WILLIAMS. CLADISTICA, A PRACTICAL CORSE IN SYSTEMATICS. OXFORD SCIENCE PUBBLICATION.
DAN GRAUR AND WEN-HSIUNG LI. FUNDAMENTALS OF MOLECULAR EVOLUTION. SINAUER ASSOCIATES, INC., PUBLISHERS SUNDERLAND, MASSACHUSETTS.
W. S. JUDD, C. S. CAMPBELL, E. A. KELLOGG, P. F. STEVENS. BOTANICA SISTEMATICA. UN APPROCCIO FILOGENETICO. EDIZIONE ITALIANA. PICCIN NUOVA LIBRARIA S.P.A., PADOVA, 2002.
A. MINELLI. BIOLOGICAL SYSTEMATICS. THE STATE OF THE ART. CHAPMAN & HALL, LONDON, 1993
A. MINELLI. PERSPECTIVES IN ANIMAL PHYLOGENY & EVOLUTION. OXFORD UNIVERSITY PRESS, 2009.
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Università Roma Tre