ANALISI STATISTICA DEI DATI ECOLOGICI E SISTEMATICI
(obiettivi)
FORMULAZIONE DI IPOTESI E VERIFICA. STATISTICA DESCRITTIVA E STATISTICA TEORICA. DINAMICA DEMOGRAFICA. I MODELLI MATEMATICI IN ECOLOGIA. USO PRATICO DI PROGRAMMI STATISTICI DI AMPIO USO. L'APPROCCIO È DI TIPO MORFOLOGICO E MOLECOLARE. L'OBIETTIVO RIGUARDA LA COMPRENSIONE E LA CONOSCENZA DELL'ANALISI FILOGENETICA E DEI MODELLI DI EVOLUZIONE MOLECOLARE, CON APPLICAZIONI IN BIOGEOGRAFIA ED IN GENETICA DI POPOLAZIONE.
|
Codice
|
20401643 |
Lingua
|
ITA |
Tipo di attestato
|
Attestato di profitto |
Crediti
|
6
|
Settore scientifico disciplinare
|
SECS-S/02
|
Ore Aula
|
48
|
Attività formativa
|
Attività formative affini ed integrative
|
Canale Unico
Docente
|
LUISELLI LUCA MARIA
(programma)
SIGNIFICATO DELLA DISCIPLINA: ANALISI STATISTICHE IN BIOLOGIA - FORMULARE IPOTESI E TESTARLE - IPOTESI NULLA -PROBABILITÀ, LIVELLI ALFA, TEST A UNA E A DUE CODE - TEST PARAMETRICI E NON PARAMETRICI - MISURE DI DISPERSIONE - IL PROBLEMA DELLA MEDIA E DELLA MEDIANA - CORRELAZIONI E REGRESSIONI - DALL'ECOLOGIA DESCRITTIVA A QUELLA TEORICA: STATISTICA DESCRITTIVA E STATISTICA PREDITTIVA -ANALISI DELLA VARIANZA - ANALISI DELLA COVARIANZA - GENERALIZED LINEAR MODELS - ANALISI MULTIVARIATA - PCA - ANALISI DISCRIMINANTE - ANALISI FATTORIALE E DELLE CORRISPONDENZE - SCOMPOSIZIONE DI UNA COMUNITÀ - ANALISI MULTIVARIATA E TEORIA DELLA NICCHIA - SOVRAPPOSIZIONE E AMPIEZZA DELLA NICCHIA - RAPPORTI PREDA-PREDATORE E LA DINAMICA DEMOGRAFICA - OCCUPANCY ANALYSIS - DISTANCE ANALYSIS - TEORIA DEL TRANSETTO LINEARE E NON LINEARE - METODI DI MONTE CARLO - SIMULAZIONI - ALGORITMI - TECNICHE DI BOOTSTRAPPING - ANALISI DELLE MATRICI E TEST DI MANTEL - CENNI SUI MODELLI MATEMATICI IN ECOLOGIA: COME SI COSTRUISCE UN MODELLO MATEMATICO - MODEL SELECTION THEORY - AKAIKE INFORMATION CRITERION - TEORIA DEL CAOS E DATI ECOLOGICI - TESTARE L'EFFICACIA DI UN MODELLO MATEMATICO - PERCHÉ GLI ECOLOGI NON SI COMPORTANO COME I FISICI NEWTONIANI: LIMITI DELL' ANALISI STATISTICA DEI DATI - TRAPPOLE E ABUSI DELLA STATISTICA ECOLOGICA - CENNI SULL'USO PRATICO DI ALCUNI PROGRAMMI DI STATISTICA DI AMPIO USO. CENNI SULLE SCUOLE DI SISTEMATICA: SCUOLA FENETICA, SCUOLA CLADISTICA E SCUOLA EVOLUZIONISTICA CLASSICA. CARATTERI MORFOLOGICI E CARATTERI MOLECOLARI, STATO DEL CARATTERE E CREAZIONE DI UNA MATRICE DI CARATTERI. ANALISI MULTIVARIATA APPLICATA ALLA FILOGENESI E ALLA SISTEMATICA: MATRICI DI DISTANZA E NEIGHBOR-JOINING (NJ). CRITERIO DELLA MASSIMA PARSIMONIA: METODI ESAUSTIVI, SEMIESAUSTIVI E METODI EURISTICI. TECNICHE DI RESAMPLING: BOOTSTRAP E JACKKNIFE. MODELLI DI EVOLUZIONE MOLECOLARE (CENNI). MAXIMUM LIKELIHOOD. ANALISI BAYESIANA. OROLOGI MOLECOLARI. CASI DI STUDIO: APPLICAZIONI IN BIOGEOGRAFIA E IN GENETICA DI POPOLAZIONE. LEZIONE PRATICA DI ANALISI DEI DATI IN SISTEMATICA MOLECOLARE: DALL'ELETTROFEROGRAMMA ALL'ALBERO FILOGENETICO. SOFTWARE UTILIZZATI NELLE ESERCITAZIONI: BIOEDIT, CLUSTAL, MEGA, PAUP, MODEL TEST, MR BAYES, TREEFINDER.
(testi)
DISPENSE DISTRIBUITE DURANTE LE LEZIONI + STATISTICA PER ORNITOLOGI E NATURALISTI, DI FOWLER, COHEN LOUIS; GOTELLI & ALLISON: A PRIMER IN ECOLOGICAL STATISTICS, SINAUER ASS. INC.; GOTELLI & GRAVES, NULL MODELS IN ECOLOGY, SMITHSONIAN INSTITUTION PRESS. FILE PDF DELLE LEZIONI SVOLTE. TESTI CONSIGLIATI: E.O. WILEY, D. SIEGEL-CAUSEY, D.R. BROOKS, V.A. FUNK, THE COMPLEAT CLADIST, A PRIMER OF PHYLOGENETIC PROCEDURES. THE UNIVERSITY OF KANSAS PRINTING SERVICE; M. NEI E S. KUMAR. MOLECULAR EVOLUTION AND PHYLOGENETICS. OXFORD UNIVERSITY PRESS 2000; P.L. FOREY, C.J. HUMPHRIES, I.L. KITCHING, R.W. SCOTLAND, D.J. SIEBERT AND D. M. WILLIAMS. CLADISTICA, A PRACTICAL CORSE IN SYSTEMATICS. OXFORD SCIENCE PUBBLICATION; DAN GRAUR AND WEN-HSIUNG LI. FUNDAMENTALS OF MOLECULAR EVOLUTION. SINAUER ASSOCIATES, INC., PUBLISHERS SUNDERLAND, MASSACHUSETTS.
|
Date di inizio e termine delle attività didattiche
|
Dal 01/03/2012 al 20/06/2012 |
Modalità di frequenza
|
Non obbligatoria
|
Docente
|
CHIARI STEFANO
(programma)
SIGNIFICATO DELLA DISCIPLINA: ANALISI STATISTICHE IN BIOLOGIA - FORMULARE IPOTESI E TESTARLE - IPOTESI NULLA -PROBABILITÀ, LIVELLI ALFA, TEST A UNA E A DUE CODE - TEST PARAMETRICI E NON PARAMETRICI - MISURE DI DISPERSIONE - IL PROBLEMA DELLA MEDIA E DELLA MEDIANA - CORRELAZIONI E REGRESSIONI - DALL'ECOLOGIA DESCRITTIVA A QUELLA TEORICA: STATISTICA DESCRITTIVA E STATISTICA PREDITTIVA -ANALISI DELLA VARIANZA - ANALISI DELLA COVARIANZA - GENERALIZED LINEAR MODELS - ANALISI MULTIVARIATA - PCA - ANALISI DISCRIMINANTE - ANALISI FATTORIALE E DELLE CORRISPONDENZE - SCOMPOSIZIONE DI UNA COMUNITÀ - ANALISI MULTIVARIATA E TEORIA DELLA NICCHIA - SOVRAPPOSIZIONE E AMPIEZZA DELLA NICCHIA - RAPPORTI PREDA-PREDATORE E LA DINAMICA DEMOGRAFICA - OCCUPANCY ANALYSIS - DISTANCE ANALYSIS - TEORIA DEL TRANSETTO LINEARE E NON LINEARE - METODI DI MONTE CARLO - SIMULAZIONI - ALGORITMI - TECNICHE DI BOOTSTRAPPING - ANALISI DELLE MATRICI E TEST DI MANTEL - CENNI SUI MODELLI MATEMATICI IN ECOLOGIA: COME SI COSTRUISCE UN MODELLO MATEMATICO - MODEL SELECTION THEORY - AKAIKE INFORMATION CRITERION - TEORIA DEL CAOS E DATI ECOLOGICI - TESTARE L'EFFICACIA DI UN MODELLO MATEMATICO - PERCHÉ GLI ECOLOGI NON SI COMPORTANO COME I FISICI NEWTONIANI: LIMITI DELL' ANALISI STATISTICA DEI DATI - TRAPPOLE E ABUSI DELLA STATISTICA ECOLOGICA - CENNI SULL'USO PRATICO DI ALCUNI PROGRAMMI DI STATISTICA DI AMPIO USO. CENNI SULLE SCUOLE DI SISTEMATICA: SCUOLA FENETICA, SCUOLA CLADISTICA E SCUOLA EVOLUZIONISTICA CLASSICA. CARATTERI MORFOLOGICI E CARATTERI MOLECOLARI, STATO DEL CARATTERE E CREAZIONE DI UNA MATRICE DI CARATTERI. ANALISI MULTIVARIATA APPLICATA ALLA FILOGENESI E ALLA SISTEMATICA: MATRICI DI DISTANZA E NEIGHBOR-JOINING (NJ). CRITERIO DELLA MASSIMA PARSIMONIA: METODI ESAUSTIVI, SEMIESAUSTIVI E METODI EURISTICI. TECNICHE DI RESAMPLING: BOOTSTRAP E JACKKNIFE. MODELLI DI EVOLUZIONE MOLECOLARE (CENNI). MAXIMUM LIKELIHOOD. ANALISI BAYESIANA. OROLOGI MOLECOLARI. CASI DI STUDIO: APPLICAZIONI IN BIOGEOGRAFIA E IN GENETICA DI POPOLAZIONE. LEZIONE PRATICA DI ANALISI DEI DATI IN SISTEMATICA MOLECOLARE: DALL'ELETTROFEROGRAMMA ALL'ALBERO FILOGENETICO. SOFTWARE UTILIZZATI NELLE ESERCITAZIONI: BIOEDIT, CLUSTAL, MEGA, PAUP, MODEL TEST, MR BAYES, TREEFINDER.
(testi)
DISPENSE DISTRIBUITE DURANTE LE LEZIONI + STATISTICA PER ORNITOLOGI E NATURALISTI, DI FOWLER, COHEN LOUIS; GOTELLI & ALLISON: A PRIMER IN ECOLOGICAL STATISTICS, SINAUER ASS. INC.; GOTELLI & GRAVES, NULL MODELS IN ECOLOGY, SMITHSONIAN INSTITUTION PRESS. FILE PDF DELLE LEZIONI SVOLTE. TESTI CONSIGLIATI: E.O. WILEY, D. SIEGEL-CAUSEY, D.R. BROOKS, V.A. FUNK, THE COMPLEAT CLADIST, A PRIMER OF PHYLOGENETIC PROCEDURES. THE UNIVERSITY OF KANSAS PRINTING SERVICE; M. NEI E S. KUMAR. MOLECULAR EVOLUTION AND PHYLOGENETICS. OXFORD UNIVERSITY PRESS 2000; P.L. FOREY, C.J. HUMPHRIES, I.L. KITCHING, R.W. SCOTLAND, D.J. SIEBERT AND D. M. WILLIAMS. CLADISTICA, A PRACTICAL CORSE IN SYSTEMATICS. OXFORD SCIENCE PUBBLICATION; DAN GRAUR AND WEN-HSIUNG LI. FUNDAMENTALS OF MOLECULAR EVOLUTION. SINAUER ASSOCIATES, INC., PUBLISHERS SUNDERLAND, MASSACHUSETTS.
|
Date di inizio e termine delle attività didattiche
|
Dal 01/03/2012 al 20/06/2012 |
Modalità di frequenza
|
Non obbligatoria
|
|
|